Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDM1Q8TC05 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MDM1Q8TC05 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDM1Q8TC05 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms