Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF397Q8NF99 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF397Q8NF99 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF397Q8NF99 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms