Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD1Q8NBU5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATAD1Q8NBU5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATAD1Q8NBU5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATAD1Q8NBU5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATAD1Q8NBU5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATAD1Q8NBU5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATAD1Q8NBU5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATAD1Q8NBU5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATAD1Q8NBU5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATAD1Q8NBU5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATAD1Q8NBU5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATAD1Q8NBU5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms