Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC71Q8N4P6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC71Q8N4P6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC71Q8N4P6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC71Q8N4P6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRRC71Q8N4P6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC71Q8N4P6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC71Q8N4P6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC71Q8N4P6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC71Q8N4P6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC71Q8N4P6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC71Q8N4P6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC71Q8N4P6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC71Q8N4P6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC71Q8N4P6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC71Q8N4P6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC71Q8N4P6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC71Q8N4P6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms