Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDCL2Q8N4E4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCL2Q8N4E4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms