Protein–RNA interactions for Protein: Q8N402

Putative uncharacterized protein LOC388882, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N402 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8N402 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8N402 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q8N402 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8N402 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8N402 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8N402 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8N402 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Q8N402 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8N402 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Q8N402 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8N402 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8N402 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q8N402 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8N402 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Q8N402 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q8N402 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8N402 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Q8N402 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8N402 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8N402 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q8N402 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8N402 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8N402 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8N402 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8N402 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8N402 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8N402 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8N402 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8N402 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8N402 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8N402 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q8N402 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8N402 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8N402 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8N402 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8N402 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8N402 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q8N402 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8N402 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8N402 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8N402 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8N402 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8N402 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8N402 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8N402 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8N402 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8N402 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8N402 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8N402 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8N402 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8N402 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8N402 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8N402 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8N402 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8N402 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8N402 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8N402 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8N402 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8N402 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8N402 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8N402 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8N402 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8N402 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8N402 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8N402 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8N402 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q8N402 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q8N402 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q8N402 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q8N402 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8N402 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8N402 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8N402 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8N402 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8N402 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8N402 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8N402 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8N402 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8N402 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8N402 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8N402 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8N402 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8N402 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8N402 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q8N402 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q8N402 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q8N402 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q8N402 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Q8N402 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q8N402 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q8N402 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q8N402 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q8N402 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q8N402 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q8N402 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q8N402 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q8N402 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q8N402 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q8N402 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms