Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BEST3Q8N1M1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BEST3Q8N1M1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEST3Q8N1M1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms