Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A6

C4orf33, UPF0462 protein C4orf33, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf33Q8N1A6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4orf33Q8N1A6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C4orf33Q8N1A6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4orf33Q8N1A6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4orf33Q8N1A6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4orf33Q8N1A6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4orf33Q8N1A6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4orf33Q8N1A6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4orf33Q8N1A6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4orf33Q8N1A6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4orf33Q8N1A6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4orf33Q8N1A6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4orf33Q8N1A6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms