Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SFTPA2Q8IWL1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFTPA2Q8IWL1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms