Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PALB2Q86YC2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PALB2Q86YC2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PALB2Q86YC2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms