Protein–RNA interactions for Protein: Q86W54

SPATA24, Spermatogenesis-associated protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA24Q86W54 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPATA24Q86W54 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPATA24Q86W54 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA24Q86W54 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms