Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDB1Q86U70 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDB1Q86U70 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDB1Q86U70 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDB1Q86U70 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDB1Q86U70 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LDB1Q86U70 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LDB1Q86U70 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDB1Q86U70 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms