Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN12Q6ZSI9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN12Q6ZSI9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136 ms