Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC36A4Q6YBV0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC36A4Q6YBV0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC36A4Q6YBV0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC36A4Q6YBV0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC36A4Q6YBV0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC36A4Q6YBV0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC36A4Q6YBV0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC36A4Q6YBV0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC36A4Q6YBV0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC36A4Q6YBV0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC36A4Q6YBV0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC36A4Q6YBV0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms