Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNCKQ6P2M8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNCKQ6P2M8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNCKQ6P2M8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNCKQ6P2M8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 364.3 ms