Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED27Q6P2C8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED27Q6P2C8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED27Q6P2C8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED27Q6P2C8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms