Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LETMD1Q6P1Q0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LETMD1Q6P1Q0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms