Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLFN13Q68D06 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN13Q68D06 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN13Q68D06 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms