Protein–RNA interactions for Protein: Q5W5X9

TTC23, Tetratricopeptide repeat protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23Q5W5X9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC23Q5W5X9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC23Q5W5X9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms