Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDZK1Q5T2W1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZK1Q5T2W1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms