Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMM23BQ5SRD1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM23BQ5SRD1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms