Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2D4BQ5SQS7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SH2D4BQ5SQS7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2D4BQ5SQS7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms