Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX6

SLC45A4, Solute carrier family 45 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A4Q5BKX6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC45A4Q5BKX6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC45A4Q5BKX6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC45A4Q5BKX6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms