Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SGO2Q562F6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGO2Q562F6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGO2Q562F6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms