Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SVEP1Q4LDE5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVEP1Q4LDE5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms