Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBM2

TMEM176B, Transmembrane protein 176B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM176BQ3YBM2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM176BQ3YBM2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM176BQ3YBM2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM176BQ3YBM2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM176BQ3YBM2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms