Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A9Q2M3M2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A9Q2M3M2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A9Q2M3M2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A9Q2M3M2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms