Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC96Q2M329 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC96Q2M329 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC96Q2M329 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC96Q2M329 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC96Q2M329 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC96Q2M329 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC96Q2M329 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC96Q2M329 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC96Q2M329 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC96Q2M329 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC96Q2M329 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC96Q2M329 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC96Q2M329 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC96Q2M329 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC96Q2M329 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC96Q2M329 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC96Q2M329 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC96Q2M329 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC96Q2M329 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC96Q2M329 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms