Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
COL24A1Q17RW2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
COL24A1Q17RW2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
COL24A1Q17RW2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
COL24A1Q17RW2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
COL24A1Q17RW2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
COL24A1Q17RW2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
COL24A1Q17RW2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
COL24A1Q17RW2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
COL24A1Q17RW2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
COL24A1Q17RW2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
COL24A1Q17RW2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
COL24A1Q17RW2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
COL24A1Q17RW2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
COL24A1Q17RW2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
COL24A1Q17RW2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
COL24A1Q17RW2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
COL24A1Q17RW2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
COL24A1Q17RW2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
COL24A1Q17RW2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
COL24A1Q17RW2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
COL24A1Q17RW2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
COL24A1Q17RW2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
COL24A1Q17RW2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
COL24A1Q17RW2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
COL24A1Q17RW2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
COL24A1Q17RW2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
COL24A1Q17RW2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms