Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CRY1Q16526 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRY1Q16526 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
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