Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KARSQ15046 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KARSQ15046 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KARSQ15046 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KARSQ15046 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KARSQ15046 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KARSQ15046 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KARSQ15046 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KARSQ15046 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KARSQ15046 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KARSQ15046 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KARSQ15046 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KARSQ15046 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KARSQ15046 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KARSQ15046 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KARSQ15046 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KARSQ15046 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KARSQ15046 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KARSQ15046 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KARSQ15046 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KARSQ15046 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KARSQ15046 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KARSQ15046 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KARSQ15046 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KARSQ15046 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KARSQ15046 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KARSQ15046 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KARSQ15046 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KARSQ15046 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KARSQ15046 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KARSQ15046 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KARSQ15046 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KARSQ15046 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KARSQ15046 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KARSQ15046 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KARSQ15046 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KARSQ15046 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KARSQ15046 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KARSQ15046 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KARSQ15046 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KARSQ15046 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KARSQ15046 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KARSQ15046 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KARSQ15046 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KARSQ15046 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KARSQ15046 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KARSQ15046 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KARSQ15046 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KARSQ15046 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KARSQ15046 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KARSQ15046 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KARSQ15046 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KARSQ15046 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KARSQ15046 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KARSQ15046 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KARSQ15046 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KARSQ15046 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KARSQ15046 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KARSQ15046 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KARSQ15046 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KARSQ15046 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KARSQ15046 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KARSQ15046 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KARSQ15046 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KARSQ15046 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KARSQ15046 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KARSQ15046 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KARSQ15046 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KARSQ15046 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KARSQ15046 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KARSQ15046 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KARSQ15046 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KARSQ15046 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KARSQ15046 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KARSQ15046 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KARSQ15046 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KARSQ15046 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KARSQ15046 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KARSQ15046 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KARSQ15046 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KARSQ15046 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KARSQ15046 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KARSQ15046 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KARSQ15046 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KARSQ15046 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KARSQ15046 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KARSQ15046 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KARSQ15046 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KARSQ15046 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KARSQ15046 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KARSQ15046 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KARSQ15046 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KARSQ15046 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KARSQ15046 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KARSQ15046 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KARSQ15046 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KARSQ15046 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KARSQ15046 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KARSQ15046 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KARSQ15046 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
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