Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MADCAM1Q13477 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MADCAM1Q13477 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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