Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIGQ13278 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIGQ13278 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIGQ13278 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIGQ13278 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIGQ13278 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIGQ13278 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIGQ13278 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIGQ13278 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIGQ13278 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIGQ13278 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIGQ13278 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIGQ13278 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIGQ13278 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIGQ13278 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIGQ13278 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIGQ13278 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIGQ13278 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIGQ13278 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIGQ13278 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIGQ13278 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIGQ13278 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIGQ13278 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIGQ13278 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIGQ13278 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIGQ13278 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIGQ13278 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIGQ13278 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIGQ13278 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIGQ13278 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIGQ13278 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIGQ13278 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIGQ13278 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIGQ13278 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIGQ13278 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIGQ13278 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIGQ13278 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIGQ13278 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RIGQ13278 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RIGQ13278 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIGQ13278 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RIGQ13278 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIGQ13278 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIGQ13278 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIGQ13278 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIGQ13278 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIGQ13278 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIGQ13278 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIGQ13278 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIGQ13278 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RIGQ13278 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIGQ13278 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIGQ13278 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIGQ13278 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIGQ13278 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIGQ13278 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIGQ13278 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIGQ13278 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIGQ13278 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIGQ13278 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIGQ13278 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIGQ13278 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIGQ13278 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIGQ13278 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIGQ13278 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIGQ13278 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIGQ13278 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RIGQ13278 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIGQ13278 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIGQ13278 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIGQ13278 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIGQ13278 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIGQ13278 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIGQ13278 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIGQ13278 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIGQ13278 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIGQ13278 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIGQ13278 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIGQ13278 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIGQ13278 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIGQ13278 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIGQ13278 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIGQ13278 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIGQ13278 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIGQ13278 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIGQ13278 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIGQ13278 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIGQ13278 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIGQ13278 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIGQ13278 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIGQ13278 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RIGQ13278 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RIGQ13278 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIGQ13278 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIGQ13278 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIGQ13278 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIGQ13278 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIGQ13278 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIGQ13278 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIGQ13278 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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