Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3Q13114 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3Q13114 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms