Protein–RNA interactions for Protein: Q13103

SPP2, Secreted phosphoprotein 24, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP2Q13103 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPP2Q13103 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPP2Q13103 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPP2Q13103 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
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