Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPRL3Q12980 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPRL3Q12980 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPRL3Q12980 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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