Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CGNL1Q0VF96 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CGNL1Q0VF96 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CGNL1Q0VF96 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CGNL1Q0VF96 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CGNL1Q0VF96 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CGNL1Q0VF96 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CGNL1Q0VF96 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CGNL1Q0VF96 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CGNL1Q0VF96 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CGNL1Q0VF96 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CGNL1Q0VF96 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CGNL1Q0VF96 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CGNL1Q0VF96 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CGNL1Q0VF96 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CGNL1Q0VF96 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CGNL1Q0VF96 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CGNL1Q0VF96 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CGNL1Q0VF96 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CGNL1Q0VF96 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CGNL1Q0VF96 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CGNL1Q0VF96 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CGNL1Q0VF96 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CGNL1Q0VF96 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms