Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
EXOSC9Q06265 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
EXOSC9Q06265 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
EXOSC9Q06265 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
EXOSC9Q06265 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms