Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DEUP1Q05D60 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DEUP1Q05D60 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DEUP1Q05D60 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DEUP1Q05D60 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DEUP1Q05D60 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DEUP1Q05D60 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DEUP1Q05D60 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DEUP1Q05D60 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEUP1Q05D60 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEUP1Q05D60 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEUP1Q05D60 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEUP1Q05D60 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEUP1Q05D60 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DEUP1Q05D60 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DEUP1Q05D60 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DEUP1Q05D60 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DEUP1Q05D60 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DEUP1Q05D60 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DEUP1Q05D60 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DEUP1Q05D60 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DEUP1Q05D60 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms