Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CALD1Q05682 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CALD1Q05682 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
CALD1Q05682 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CALD1Q05682 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms