Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNB2Q03252 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMNB2Q03252 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNB2Q03252 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNB2Q03252 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms