Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPARDQ03181 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PPARDQ03181 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARDQ03181 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms