Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
B4GALNT1Q00973 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4GALNT1Q00973 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT1Q00973 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
B4GALNT1Q00973 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms