Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNB1P98172 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFNB1P98172 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms