Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD23AP54725 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23AP54725 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD23AP54725 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD23AP54725 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms