Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDR1P51861 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDR1P51861 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDR1P51861 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDR1P51861 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDR1P51861 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDR1P51861 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDR1P51861 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDR1P51861 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDR1P51861 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDR1P51861 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDR1P51861 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDR1P51861 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDR1P51861 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDR1P51861 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDR1P51861 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDR1P51861 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDR1P51861 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDR1P51861 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDR1P51861 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDR1P51861 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CDR1P51861 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CDR1P51861 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDR1P51861 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDR1P51861 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDR1P51861 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDR1P51861 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDR1P51861 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDR1P51861 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDR1P51861 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDR1P51861 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDR1P51861 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDR1P51861 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDR1P51861 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDR1P51861 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDR1P51861 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDR1P51861 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDR1P51861 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDR1P51861 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDR1P51861 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDR1P51861 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDR1P51861 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDR1P51861 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDR1P51861 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDR1P51861 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDR1P51861 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDR1P51861 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDR1P51861 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDR1P51861 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDR1P51861 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDR1P51861 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDR1P51861 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDR1P51861 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDR1P51861 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDR1P51861 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDR1P51861 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDR1P51861 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDR1P51861 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDR1P51861 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDR1P51861 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDR1P51861 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDR1P51861 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDR1P51861 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDR1P51861 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDR1P51861 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDR1P51861 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDR1P51861 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDR1P51861 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDR1P51861 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDR1P51861 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDR1P51861 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDR1P51861 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDR1P51861 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDR1P51861 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDR1P51861 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDR1P51861 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDR1P51861 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDR1P51861 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDR1P51861 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDR1P51861 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDR1P51861 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDR1P51861 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDR1P51861 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDR1P51861 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDR1P51861 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDR1P51861 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDR1P51861 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CDR1P51861 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDR1P51861 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDR1P51861 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDR1P51861 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDR1P51861 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDR1P51861 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDR1P51861 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDR1P51861 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDR1P51861 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDR1P51861 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDR1P51861 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDR1P51861 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDR1P51861 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms