Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSC2P49815 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSC2P49815 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSC2P49815 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSC2P49815 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSC2P49815 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSC2P49815 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSC2P49815 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSC2P49815 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TSC2P49815 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSC2P49815 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSC2P49815 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TSC2P49815 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSC2P49815 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSC2P49815 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSC2P49815 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSC2P49815 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSC2P49815 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSC2P49815 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TSC2P49815 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSC2P49815 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSC2P49815 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSC2P49815 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSC2P49815 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSC2P49815 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSC2P49815 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSC2P49815 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSC2P49815 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSC2P49815 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TSC2P49815 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSC2P49815 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TSC2P49815 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TSC2P49815 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSC2P49815 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSC2P49815 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSC2P49815 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSC2P49815 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSC2P49815 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TSC2P49815 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSC2P49815 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSC2P49815 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSC2P49815 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSC2P49815 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSC2P49815 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TSC2P49815 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSC2P49815 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSC2P49815 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSC2P49815 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSC2P49815 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSC2P49815 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSC2P49815 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSC2P49815 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSC2P49815 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSC2P49815 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSC2P49815 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSC2P49815 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSC2P49815 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSC2P49815 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSC2P49815 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSC2P49815 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSC2P49815 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSC2P49815 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSC2P49815 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSC2P49815 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSC2P49815 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSC2P49815 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TSC2P49815 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSC2P49815 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TSC2P49815 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TSC2P49815 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSC2P49815 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSC2P49815 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSC2P49815 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSC2P49815 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSC2P49815 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSC2P49815 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSC2P49815 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSC2P49815 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSC2P49815 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSC2P49815 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSC2P49815 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSC2P49815 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSC2P49815 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSC2P49815 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSC2P49815 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSC2P49815 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSC2P49815 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSC2P49815 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSC2P49815 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSC2P49815 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSC2P49815 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSC2P49815 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TSC2P49815 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSC2P49815 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSC2P49815 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSC2P49815 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSC2P49815 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSC2P49815 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSC2P49815 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSC2P49815 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms