Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCKSL1P49006 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCKSL1P49006 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
MARCKSL1P49006 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms