Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A3P48764 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC9A3P48764 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A3P48764 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms