Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC4A3P48751 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SLC4A3P48751 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC4A3P48751 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms